問題內(nèi)容：2008年之前，民辦非營利醫(yī)院免稅是依據(jù)財稅[2000]42號文，新的《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》及《中華人民共和國企業(yè)所得稅法實(shí)施條例》從2008年1月1日實(shí)施后，當(dāng)?shù)囟悇?wù)部門說財稅[2000]42號文關(guān)于所得稅減免優(yōu)惠便自動廢止，合資格的民辦非營利醫(yī)院都要納所得稅。問題1、財稅[2000]42號文有關(guān)稅收優(yōu)惠(除營業(yè)稅外)現(xiàn)在是否有效？問題2、符合條件的民辦非營利醫(yī)院(指符合條件的醫(yī)療收入)是否免所得稅，依據(jù)是什么？問題3、醫(yī)院在稅法上分營利和非營利性質(zhì)，全國的公立醫(yī)院(非營利)減免稅是依據(jù)什么法規(guī)或文件(當(dāng)?shù)氐囟惒块T說《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》和《中華人民共和國企業(yè)所得稅法實(shí)施條例》及財稅[2009]122號文都沒有明確規(guī)定非營利醫(yī)院免征所得稅)問題4、新的《中華人民共和國營業(yè)稅暫行條例》是從2008年11月10號頒報，2009年1月1日實(shí)施的，國家財政部 國家稅務(wù)總局在2009年5月18日專門發(fā)文：財稅[2009]61號通知中二：部分廢止或失效的文件的第9點(diǎn)：財稅[2009]42號有關(guān)營利稅的規(guī)定，而財稅[2000]42號有關(guān)所得稅規(guī)定在《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》及《中華人民共和國企業(yè)所得稅法實(shí)施條例》從2008年1月1日實(shí)施至今，都沒有發(fā)什么文件廢止或失效，為什么有不同處理方法？是否從另一個側(cè)面說財稅[2009]42號仍然有效？問題5、現(xiàn)在全國各地對民辦非營利醫(yī)院在所得稅征收政策不統(tǒng)一：有的征，有的免，為什么稅務(wù)總局沒有統(tǒng)一的規(guī)定？

　　回復(fù)意見：根據(jù)《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)所得稅若干優(yōu)惠政策的通知》(財稅[2008]1號)第五條規(guī)定，除《企業(yè)所得稅法》、《企業(yè)所得稅法實(shí)施條例》、《國務(wù)院關(guān)于實(shí)施企業(yè)所得稅過渡優(yōu)惠政策的通知》(國發(fā)[2007]39號)，《國務(wù)院關(guān)于經(jīng)濟(jì)特區(qū)和上海浦東新區(qū)新設(shè)立高新技術(shù)企業(yè)實(shí)行過渡性稅收優(yōu)惠的通知》(國發(fā)[2007]40號)及本通知規(guī)定的優(yōu)惠政策以外，2008年1月1日之前實(shí)施的其他企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策一律廢止。各地區(qū)、各部門一律不得越權(quán)制定企業(yè)所得稅的優(yōu)惠政策。原《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)有關(guān)稅收政策的通知》(財稅[2000]42號)未列入繼續(xù)有效的稅收政策范圍。

　　根據(jù)《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)有關(guān)稅收政策的通知》(財稅[2000]42號)規(guī)定，醫(yī)療機(jī)構(gòu)需要書面向衛(wèi)生行政主管部門申明其性質(zhì)，按《醫(yī)療機(jī)構(gòu)管理條例》進(jìn)行設(shè)置審批和登記注冊，并由接受其登記注冊的衛(wèi)生行政部門核定，在執(zhí)業(yè)登記中注明“非營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)”和“營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)”。上述醫(yī)療機(jī)構(gòu)具體包括：各級各類醫(yī)院、門診部(所)、社區(qū)衛(wèi)生服務(wù)中心(站)、急救中心(站)、城鄉(xiāng)衛(wèi)生院、護(hù)理院(所)、療養(yǎng)院、臨床檢驗中心等。從以上可以看出，非營利醫(yī)院實(shí)際上主要是公立醫(yī)院，實(shí)踐中“非營利性醫(yī)療機(jī)構(gòu)”的認(rèn)定存在不夠規(guī)范的問題。

　　實(shí)行新企業(yè)所得稅法后，根據(jù)《企業(yè)所得稅法》第二十六條、《企業(yè)所得稅法實(shí)施條例》第八十四條、第八十五條、《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于非營利組織企業(yè)所得稅免稅收入問題的通知》(財稅[2009]122號)、《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于非營利組織免稅資格認(rèn)定管理有關(guān)問題的通知》(財稅[2009]123號)等規(guī)定，非營利組織的下列收入為免稅收入：一是接受其他單位或者個人捐贈的收入;二是除《企業(yè)所得稅法》第七條規(guī)定的財政撥款以外的其他政府補(bǔ)助收入，但不包括因政府購買服務(wù)取得的收入;三是按照省級以上民政、財政部門規(guī)定收取的會費(fèi);四是不征稅收入和免稅收入孳生的銀行存款利息收入;五是財政部、國家稅務(wù)總局規(guī)定的其他收入。民辦非營利醫(yī)院經(jīng)有關(guān)部門認(rèn)定為非營利組織后，可以按以上規(guī)定享受非營利組織的有關(guān)稅收政策。