明確診斷口腔念珠菌病，除依靠病史和臨床表現(xiàn)外，還需要實驗室檢查證實損害組織中存在病原菌。念珠菌實驗室檢測方法包括涂片法、分離培養(yǎng)、組織病理學(xué)檢查、免疫學(xué)和基因診斷等。一般來說，臨床上常用的方法是前三種。
　　1.涂片法
　　只能發(fā)現(xiàn)真菌而不能確定菌種，對于口腔黏膜干燥的患者陽性率也較低。
　　2.培養(yǎng)法
　　將標(biāo)本接種于沙氏培養(yǎng)基，經(jīng)3～4日后，形成乳白色圓形突起的菌落。若接種在玉米瓊脂培養(yǎng)基上，則菌落發(fā)育更旺盛，中心隆起。鏡檢若查見厚壁孢子，可確診為白色念珠菌。
　　3.免疫法
　　用間接免疫熒光法測定血清和非刺激性混合唾液的抗念珠菌熒光抗體。因存在較強的免疫交叉反應(yīng)性，故假陽性率（誤檢率）較高。
　　4.活檢法
　　對于慢性或肥厚性損害可進(jìn)行活檢，將組織切片用PAS染色，鏡下可見增生的口腔黏膜上皮細(xì)胞間有芽生孢子和菌絲。
　　5.基因診斷
　　近年來，分子水平的研究使得對念珠菌的認(rèn)識突破表型鑒定的局限，應(yīng)用基因分型方法對念珠菌進(jìn)行種間鑒別和種內(nèi)分型，為臨床診斷和流行病學(xué)研究提供了更能反映物種本質(zhì)的工具。