物流業(yè)務(wù)從流轉(zhuǎn)稅的角度講，主要涉及到增值稅和營(yíng)業(yè)稅兩大稅種。在增值稅和營(yíng)業(yè)稅的征稅范圍中，并沒(méi)有明確規(guī)定"物流"這一稅目，因此，在稅務(wù)管理實(shí)踐中，從事物流的企業(yè)應(yīng)當(dāng)根據(jù)自身的經(jīng)營(yíng)范圍和收入來(lái)源來(lái)確定如何繳納流轉(zhuǎn)稅。當(dāng)然，如果物流企業(yè)兼營(yíng)增值稅勞務(wù)或者提供交通運(yùn)輸業(yè)和服務(wù)業(yè)以外的其他稅目的營(yíng)業(yè)稅勞務(wù)，就超出了物流企業(yè)的經(jīng)營(yíng)范圍，因此不再是純粹的物流企業(yè)，如郵政物流業(yè)務(wù)包括一體化物流，貨代業(yè)務(wù)，專遞、快遞業(yè)務(wù)、區(qū)域配送業(yè)務(wù)，倉(cāng)儲(chǔ)業(yè)務(wù)等等。對(duì)于郵政物流業(yè)務(wù)，除《營(yíng)業(yè)稅稅目注釋》中明確規(guī)定屬于郵政通信業(yè)稅目征稅范圍的業(yè)務(wù)外，其他物流業(yè)務(wù)應(yīng)當(dāng)比照上述原則征收流轉(zhuǎn)稅。因此，對(duì)物流企業(yè)的進(jìn)行納稅檢查，就應(yīng)該根據(jù)有關(guān)企業(yè)的業(yè)務(wù)情況，確定檢查方法。
　　對(duì)物流業(yè)務(wù)征稅，要根據(jù)物流業(yè)務(wù)的具體功能并對(duì)照現(xiàn)行稅法規(guī)定來(lái)分析，納稅檢查也要圍繞相應(yīng)的經(jīng)濟(jì)事項(xiàng)進(jìn)行。從稅收的角度講，物流業(yè)務(wù)包括以下幾個(gè)項(xiàng)目。
　　其一，交通運(yùn)輸業(yè)務(wù)。物流企業(yè)提供搬運(yùn)、裝卸、運(yùn)輸勞務(wù)取得的收入，屬于營(yíng)業(yè)稅"交通運(yùn)輸業(yè)"稅目的征稅范圍，適用3%的稅率。
　　其二，服務(wù)業(yè)務(wù)。物流企業(yè)提供儲(chǔ)存、保管、信息勞務(wù)取得的收入屬于營(yíng)業(yè)稅"服務(wù)業(yè)"稅目的征稅范圍，適用5%的稅率。
　　其三，增值稅業(yè)務(wù)。物流企業(yè)提供包裝、流通加工勞務(wù)取得的收入屬于增值稅的征稅范圍，其適用稅率要根據(jù)納稅人應(yīng)繳納的增值稅所適用的增值稅率情況來(lái)確定。
　　其四，混合銷售業(yè)務(wù)。物流企業(yè)提供配送勞務(wù)取得的收入屬于混合銷售收入。因?yàn)槲锪髌髽I(yè)一般是以提供營(yíng)業(yè)稅勞務(wù)為主，所以對(duì)于物流企業(yè)的混合銷售行為（在提供營(yíng)業(yè)稅勞務(wù)的同時(shí)提供包裝、加工等增值稅勞務(wù)的）應(yīng)當(dāng)征收營(yíng)業(yè)稅，但是，根據(jù)財(cái)政部、國(guó)家稅務(wù)總局（94）財(cái)稅字第026號(hào)通知規(guī)定，從事運(yùn)輸業(yè)務(wù)的單位和個(gè)人，發(fā)生銷售貨物并負(fù)責(zé)運(yùn)輸所售貨物的混合銷售行為，征收增值稅。
　　其五，兼營(yíng)業(yè)務(wù)。如果物流企業(yè)在提供交通運(yùn)輸業(yè)勞務(wù)時(shí)，同時(shí)提供服務(wù)業(yè)勞務(wù)的，應(yīng)當(dāng)分別核算不同稅目的營(yíng)業(yè)收入，并分別申報(bào)繳納交通運(yùn)輸業(yè)營(yíng)業(yè)稅和服務(wù)業(yè)營(yíng)業(yè)稅。凡未按規(guī)定分別核算應(yīng)稅收入的，一律從高適用稅率，按"服務(wù)業(yè)"稅目征收營(yíng)業(yè)稅。如果物流企業(yè)兼營(yíng)營(yíng)業(yè)稅勞務(wù)和增值稅勞務(wù)，能夠分別核算營(yíng)業(yè)稅收入和增值稅收入的，可分別申報(bào)繳納營(yíng)業(yè)稅和增值稅；不能分別核算收入的，一律征收增值稅。
　　從目前企業(yè)的生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)情況來(lái)看，物流業(yè)務(wù)涉及到所有納稅人。從稅務(wù)管理系統(tǒng)提供的信息反映，目前對(duì)物流業(yè)務(wù)的處理存在的問(wèn)題較多。主要的有兩個(gè)方面：
　　其一，對(duì)運(yùn)輸業(yè)務(wù)的稅收政策把握不準(zhǔn)確，導(dǎo)致大量運(yùn)輸中所含的增值稅不能抵扣。
　　其二，技術(shù)操作不當(dāng)，導(dǎo)致企業(yè)運(yùn)輸?shù)亩愂粘杀炯哟蟆?
　　有鑒于此，我們有必要從有關(guān)物流企業(yè)的稅收政策的具體規(guī)定的分析開(kāi)始，討論如何進(jìn)行納稅檢查。另外，對(duì)于聯(lián)運(yùn)業(yè)務(wù)，財(cái)政部、國(guó)家稅務(wù)總局《關(guān)于營(yíng)業(yè)稅若干政策問(wèn)題的通知》（財(cái)稅[2003]16號(hào)）規(guī)定，經(jīng)地方稅務(wù)機(jī)關(guān)批準(zhǔn)使用運(yùn)輸企業(yè)發(fā)票，按"交通運(yùn)輸業(yè)"稅目征收營(yíng)業(yè)稅的單位將承擔(dān)的運(yùn)輸業(yè)務(wù)分給其他運(yùn)輸企業(yè)并由其統(tǒng)一收取價(jià)款的，以其取得的全部收入減去支付給其他運(yùn)輸企業(yè)的運(yùn)費(fèi)后的余額為營(yíng)業(yè)額。由于目前我國(guó)的物流企業(yè)的物流業(yè)務(wù)仍是以交通運(yùn)輸業(yè)務(wù)為主，所以在這里我們以交通運(yùn)輸業(yè)務(wù)的營(yíng)業(yè)稅檢查作為討論的重點(diǎn)問(wèn)題。