《企業(yè)所得稅法》及《企業(yè)所得稅法實施條例》規(guī)定，企業(yè)從事《國家重點支持的高新技術(shù)領(lǐng)域》和國家發(fā)展和改革委員會等部門公布的規(guī)定項目的研究開發(fā)活動，其在一個納稅年度中實際發(fā)生的研究開發(fā)費用支出，允許在計算應(yīng)納稅所得額時按照規(guī)定實行加計扣除。為確保企業(yè)能夠有效享受稅收優(yōu)惠政策，企業(yè)在進行財務(wù)處理時應(yīng)準確把握研發(fā)費用在會計核算和稅法要求上的異同，用足用好稅收優(yōu)惠政策。 

　  核算依據(jù)不同。企業(yè)研發(fā)費用會計核算主要依據(jù)《財政部關(guān)于企業(yè)加強研發(fā)費用財務(wù)管理的若干意見》（財企〔2007〕194號）。所得稅匯算清繳，研發(fā)費用的主要依據(jù)是《企業(yè)研究開發(fā)費用稅前扣除管理辦法（試行）》（國稅發(fā)〔2008〕116號）。

　  人工費用范圍不同。企業(yè)會計處理時可列入“研發(fā)費用”科目的人工費用主要包括：企業(yè)在職研發(fā)人員的工資、獎金、津貼、補貼、社會保險費、住房公積金等人工費用以及外聘研發(fā)人員的勞務(wù)費用。所得稅匯算清繳時企業(yè)可加計扣除的研發(fā)費用中的人工費用包括：在職直接從事研發(fā)活動人員的工資、薪金、獎金、津貼、補貼。所得稅匯算清繳對研發(fā)費用加計扣除的規(guī)定范圍比會計處理的范圍小。

　  直接投入費用內(nèi)容基本一致。財務(wù)核算中研發(fā)費用涉及的直接投入費用主要包括直接消耗的材料、燃料、動力費用。所得稅匯算清繳中研發(fā)費用涉及的直接投入費用包括從事研發(fā)活動直接消耗的材料、燃料和動力費用。二者的內(nèi)容基本一致。

　  其他直接費用范圍不同。財務(wù)核算中，企業(yè)研發(fā)費用涉及的其他直接費用主要包括：與研發(fā)活動直接相關(guān)的技術(shù)圖書資料費、資料翻譯費、會議費、差旅費、辦公費、外事費、研發(fā)人員培訓(xùn)費、培養(yǎng)費、專家咨詢費、高新科技研發(fā)保險費用等。所得稅匯算清繳中，可以加計扣除的研究開發(fā)費用不包括會議費、差旅費、辦公費、外事費、研發(fā)人員培訓(xùn)費、培養(yǎng)費、專家咨詢費、高新科技研發(fā)保險費用等。所得稅匯算清繳對研發(fā)費用加計扣除的規(guī)定范圍比會計處理的范圍小。

　  固定資產(chǎn)折舊扣除不同。在財務(wù)核算中，研發(fā)費用的扣除范圍不僅包括機器設(shè)備的折舊費，還包括房屋的折舊費。所得稅匯算清繳時涉及研發(fā)費用的加計扣除時只包含機器設(shè)備的折舊費。所得稅匯算清繳對研發(fā)費用加計扣除的規(guī)定范圍比會計處理的范圍小。