三、應(yīng)納稅額的計算

　　(一)計算應(yīng)納稅額的時間限定

　　增值稅一般納稅人申請抵扣的防偽稅控系統(tǒng)開具的增值稅專用發(fā)票，必須自該專用發(fā)票開具之日起90日內(nèi)到稅務(wù)機(jī)關(guān)認(rèn)證，否則不予抵扣進(jìn)項稅額。

　　超過90天未認(rèn)證的發(fā)票不可以做作廢處理，不可以退回重新開具。

　　增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的增值稅專用發(fā)票、公路內(nèi)河貨物運輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票和機(jī)動車銷售統(tǒng)一發(fā)票，應(yīng)在開具之日起180日內(nèi)到稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理認(rèn)證，并在認(rèn)證通過的次月申報期內(nèi)，向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報抵扣進(jìn)項稅額。納稅人取得2009年12月31日以前開具的增值稅扣稅憑證，仍按原規(guī)定執(zhí)行。

　　實行海關(guān)進(jìn)口增值稅專用繳款書(以下簡稱海關(guān)繳款書)“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的海關(guān)繳款書，應(yīng)在開具之日起180日內(nèi)向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)報送《海關(guān)完稅憑證抵扣清單》(包括紙質(zhì)資料和電子數(shù)據(jù))申請稽核比對。

　　未實行海關(guān)繳款書“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的海關(guān)繳款書，應(yīng)在開具之日起180日后的第一個納稅申報期結(jié)束以前，向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報抵扣進(jìn)項稅額。納稅人取得2009年12月31日以前開具的增值稅扣稅憑證，仍按原規(guī)定執(zhí)行。

　　(二)計算應(yīng)納稅額時進(jìn)項稅額不足抵扣的處理

　　根據(jù)稅法規(guī)定，當(dāng)期進(jìn)項稅額不足抵扣的部分可以結(jié)轉(zhuǎn)下期繼續(xù)抵扣。

　　(三)銷貨退回或折讓涉及到銷項稅額和進(jìn)項稅額的稅務(wù)處理

　　對于納稅人進(jìn)貨退出或折讓而不扣減當(dāng)期進(jìn)項稅額，造成不納稅或少納稅的，都將被認(rèn)定為是偷稅行為，并按偷稅予以處罰。

　　(四)向供貨方取得返還收入的稅務(wù)處理

　　自2004年7月1日起，對商業(yè)企業(yè)向供貨方收取的與商品銷售量、銷售額掛鉤(如以一定比例、金額、數(shù)量計算)的各種返還收入，均應(yīng)按照平銷返利行為的有關(guān)規(guī)定沖減當(dāng)期增值稅進(jìn)項稅金。應(yīng)沖減進(jìn)項稅金的計算公式調(diào)整為：

　　當(dāng)期應(yīng)沖減進(jìn)項稅金=當(dāng)期取得的返還資金÷(1+所購貨物適用增值稅稅率)×所購貨物適用增值稅稅率

　　商業(yè)企業(yè)向供貨方收取的各種返還收入，一律不得開具增值稅專用發(fā)票。

　　(五)一般納稅人注銷時進(jìn)項稅額的處理

　　一般納稅人注銷或取消輔導(dǎo)期一般納稅人資格，轉(zhuǎn)為小規(guī)模納稅人時，其存貨不作進(jìn)項稅額轉(zhuǎn)出處理，其留抵稅額也不予以退稅。